2009年,当麻(má )纱绫(líng )(户田惠梨香 饰)和濑文焚流(加濑亮 饰)相识的前一年。在美国FBI学成归来的当麻被分在警视厅公安部公安第五课未详事件特(tè )别(bié )对策系(xì ),接受组长野野村光太郎的直接领导。此前不久,某大型石油企业高管接连被人杀害,死(sǐ )者的心脏无一例外都留下被人用手捏(niē )过的痕迹。显而易见,这一系列事件和所谓的SPEC持有者有着极为密切的联系。与此同时,石油企业高管Diablo(大杉涟 饰)高薪聘请神秘SPEC持有(yǒu )者一十(shí )一(神木隆之介 饰),企(qǐ )图(tú )阻挡神秘的SPEC杀手。一十一,这个日后与当麻和濑文(wén )有着不解渊源的难缠敌手将当麻视作杀害父母的爆弹女,之后更斩杀了当麻在美国结识的好(hǎo )友Nancy。
SPEC宏大篇章自此拉开序幕,决定世界命运的重大事件也进入了倒计时…